造潜艇其实也只是一时权宜之计，因此在进入“海军假日时期”之后，日本开始减缓了潜艇的建造，开始转而建造大型战舰。
这导致在二战爆发之后，日本虽然拥有着大规模的潜艇部队，却大多为早期建造的老旧型号，在海军发展日新月异的这个时期，这种落后是极为可怕的。
其次就是潜艇应用落后。日本虽然拥有着数量庞大的潜艇部队，但却很少将其作为一支单独的部队来使用，而更多是将其作为一种辅助舰艇来使用，更多承担的是侦查、运输任务，而很少直接承担作战任务。
这种使用方式的落后，不仅严重制约了潜艇部队的发挥，而且在与美国潜艇的交战中也全面落于下风，满载货物的日本潜艇哪里是直接用于攻击的美国潜艇的对手。
即使到太平洋战争后期，在水面舰艇损失惨重的情况下，日本竟然仍没有将潜艇部队作为主力，宁愿采取所谓的“神风敢死队”作战方式，也没有像德国那样采用“野狼战术”。
同样的在当前位面，日本海军依然没有意识到这个问题，在这支特混舰队里编配的十余艘潜艇，主要用途依旧还是侦查、运输任务，而不是去更远的阿拉伯海域狩猎英国海军皇军舰队和运输船队。
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